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Santiago Cueto es director ejecutivo e investigador principal de Grupo de Análisis para el Desarrollo (GRADE), además es profesor principal del Departamento de Psicología de la Pontificia Universidad Católica del Perú. Fue miembro del Consejo Nacional de Educación (CNE), del Consejo Técnico del Instituto Nacional para la Evaluación de la Educación (INEE) de México, presidente de la Sociedad de Investigación Educativa Peruana (SIEP) y secretario ejecutivo del Fondo de Investigación para la Educación del Programa de Promoción de la Reforma Educativa en América Latina y el Caribe (Diálogo Interamericano). Ha sido consultor de organismos internacionales como el Banco Interamericano de Desarrollo (BID), el Banco Mundial y la Organización de las Naciones Unidas para la Educación, la Ciencia y la Cultura (UNESCO).
En la conferencia anual del Global Development Network (GDN) de 2003 fue premiado con la medalla a la mejor investigación en la categoría Educación, Conocimiento y Tecnología. En el 2010, obtuvo el Premio Nacional de Psicología del Colegio Nacional de Psicólogos del Perú. En el 2016, fue nombrado exalumno distinguido de la Pontificia Universidad Católica del Perú. En el 2018, fue condecorado por el Ministerio de Educación con las Palmas Magisteriales en el grado de Amauta.
Cueto es psicólogo educacional por la Pontificia Universidad Católica del Perú y doctor en psicología educacional por la Universidad de Indiana, Estados Unidos. Ha sido investigador visitante de la Universidad de California en Davis y en la Universidad de Oxford.
Cueto participó como panelista en un evento del Diálogo Interamericano.